Помимо серии фресок в капелле делъ Арена, единственными дошедшими до нас фресками, которые с уверенностью приписываются Джотто, считаются работы, украшающие капеллы Барди и Перуцци во Флоренции.
В капелле Барди сохранились семь фресок с изображением сцен из жизни святого Франциска. В часовне Перуцци уцелели шесть фресок: три — с изображением святого Иоанна Крестителя, и еще три — посвященные жизни Иоанна Богослова. В XVIII веке все они были закрашены белой краской.
К стене с фреской, изображающей смерть святого Франциска, пристроили гробницу. В 1950-е годы эти работы Джотто подверглись тщательной реставрации. К сожалению, в ряде случаев разрушительное действие времени оказалось необратимым. Это особенно хорошо видно по фреске «Пир Ирода» в капелле Перуцци.
Гораздо выразительнее выглядят фрески в капелле Барди. Датируются все эти работы 1320-ми годами.